Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP7BP35670 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ATP7BP35670 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ATP7BP35670 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms