Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC48.12■■■■■ 5.29
ATP7BP35670 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC47.45■■■■■ 5.19
ATP7BP35670 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
ATP7BP35670 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.72■■■■■ 5.07
ATP7BP35670 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
ATP7BP35670 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.36■■■■■ 5.01
ATP7BP35670 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
ATP7BP35670 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.07■■■■■ 4.96
ATP7BP35670 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
ATP7BP35670 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
ATP7BP35670 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC45.23■■■■■ 4.83
ATP7BP35670 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC45.22■■■■■ 4.83
ATP7BP35670 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
ATP7BP35670 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
ATP7BP35670 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
ATP7BP35670 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
ATP7BP35670 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
ATP7BP35670 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
ATP7BP35670 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
ATP7BP35670 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
ATP7BP35670 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ATP7BP35670 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
ATP7BP35670 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
ATP7BP35670 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
ATP7BP35670 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
ATP7BP35670 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
ATP7BP35670 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
ATP7BP35670 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
ATP7BP35670 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
ATP7BP35670 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
ATP7BP35670 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
ATP7BP35670 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
ATP7BP35670 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
ATP7BP35670 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
ATP7BP35670 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
ATP7BP35670 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
ATP7BP35670 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
ATP7BP35670 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
ATP7BP35670 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
ATP7BP35670 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
ATP7BP35670 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
ATP7BP35670 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
ATP7BP35670 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
ATP7BP35670 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
ATP7BP35670 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
ATP7BP35670 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
ATP7BP35670 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
ATP7BP35670 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
ATP7BP35670 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ATP7BP35670 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
ATP7BP35670 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
ATP7BP35670 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
ATP7BP35670 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
ATP7BP35670 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
ATP7BP35670 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
ATP7BP35670 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
ATP7BP35670 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
ATP7BP35670 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ATP7BP35670 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ATP7BP35670 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ATP7BP35670 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
ATP7BP35670 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
ATP7BP35670 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
ATP7BP35670 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
ATP7BP35670 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
ATP7BP35670 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
ATP7BP35670 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ATP7BP35670 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ATP7BP35670 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
ATP7BP35670 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ATP7BP35670 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ATP7BP35670 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ATP7BP35670 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ATP7BP35670 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ATP7BP35670 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ATP7BP35670 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ATP7BP35670 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ATP7BP35670 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
ATP7BP35670 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ATP7BP35670 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ATP7BP35670 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ATP7BP35670 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
ATP7BP35670 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
ATP7BP35670 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.19
ATP7BP35670 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ATP7BP35670 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
ATP7BP35670 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ATP7BP35670 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ATP7BP35670 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ATP7BP35670 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ATP7BP35670 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ATP7BP35670 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ATP7BP35670 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
ATP7BP35670 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ATP7BP35670 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ATP7BP35670 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ATP7BP35670 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
ATP7BP35670 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
ATP7BP35670 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ATP7BP35670 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms