Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PVALBP20472 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PVALBP20472 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PVALBP20472 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PVALBP20472 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PVALBP20472 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PVALBP20472 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PVALBP20472 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PVALBP20472 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PVALBP20472 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PVALBP20472 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PVALBP20472 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PVALBP20472 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PVALBP20472 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PVALBP20472 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PVALBP20472 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PVALBP20472 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PVALBP20472 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PVALBP20472 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PVALBP20472 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PVALBP20472 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PVALBP20472 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PVALBP20472 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PVALBP20472 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PVALBP20472 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PVALBP20472 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PVALBP20472 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PVALBP20472 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PVALBP20472 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PVALBP20472 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PVALBP20472 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PVALBP20472 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PVALBP20472 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PVALBP20472 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PVALBP20472 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PVALBP20472 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PVALBP20472 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PVALBP20472 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PVALBP20472 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PVALBP20472 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PVALBP20472 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PVALBP20472 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PVALBP20472 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PVALBP20472 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PVALBP20472 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PVALBP20472 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PVALBP20472 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PVALBP20472 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PVALBP20472 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PVALBP20472 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PVALBP20472 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PVALBP20472 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PVALBP20472 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PVALBP20472 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PVALBP20472 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PVALBP20472 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PVALBP20472 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PVALBP20472 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PVALBP20472 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PVALBP20472 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PVALBP20472 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PVALBP20472 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PVALBP20472 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PVALBP20472 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PVALBP20472 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PVALBP20472 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PVALBP20472 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PVALBP20472 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PVALBP20472 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PVALBP20472 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PVALBP20472 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PVALBP20472 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PVALBP20472 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PVALBP20472 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PVALBP20472 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PVALBP20472 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PVALBP20472 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PVALBP20472 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PVALBP20472 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PVALBP20472 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PVALBP20472 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PVALBP20472 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PVALBP20472 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PVALBP20472 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PVALBP20472 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PVALBP20472 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PVALBP20472 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PVALBP20472 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PVALBP20472 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PVALBP20472 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PVALBP20472 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PVALBP20472 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PVALBP20472 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PVALBP20472 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PVALBP20472 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PVALBP20472 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PVALBP20472 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PVALBP20472 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PVALBP20472 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PVALBP20472 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms