Protein–RNA interactions for Protein: P20062

TCN2, Transcobalamin-2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN2P20062 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCN2P20062 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCN2P20062 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCN2P20062 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCN2P20062 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCN2P20062 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCN2P20062 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCN2P20062 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCN2P20062 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCN2P20062 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCN2P20062 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCN2P20062 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCN2P20062 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCN2P20062 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCN2P20062 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCN2P20062 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCN2P20062 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCN2P20062 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN2P20062 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN2P20062 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN2P20062 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN2P20062 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN2P20062 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN2P20062 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCN2P20062 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCN2P20062 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCN2P20062 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCN2P20062 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCN2P20062 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCN2P20062 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCN2P20062 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCN2P20062 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCN2P20062 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCN2P20062 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCN2P20062 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCN2P20062 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN2P20062 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN2P20062 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN2P20062 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN2P20062 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN2P20062 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN2P20062 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN2P20062 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN2P20062 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCN2P20062 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCN2P20062 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCN2P20062 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCN2P20062 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN2P20062 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN2P20062 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN2P20062 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN2P20062 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCN2P20062 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCN2P20062 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCN2P20062 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCN2P20062 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCN2P20062 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCN2P20062 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCN2P20062 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCN2P20062 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCN2P20062 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCN2P20062 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCN2P20062 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCN2P20062 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCN2P20062 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCN2P20062 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCN2P20062 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCN2P20062 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCN2P20062 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCN2P20062 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCN2P20062 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCN2P20062 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCN2P20062 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCN2P20062 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCN2P20062 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCN2P20062 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCN2P20062 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCN2P20062 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCN2P20062 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCN2P20062 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCN2P20062 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCN2P20062 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCN2P20062 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCN2P20062 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TCN2P20062 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCN2P20062 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCN2P20062 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCN2P20062 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCN2P20062 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCN2P20062 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCN2P20062 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCN2P20062 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TCN2P20062 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCN2P20062 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCN2P20062 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN2P20062 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN2P20062 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN2P20062 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN2P20062 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN2P20062 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms