Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VCAM1P19320 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VCAM1P19320 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VCAM1P19320 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms