Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP2A2P16615 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2A2P16615 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP2A2P16615 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms