Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF4P15884 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF4P15884 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF4P15884 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF4P15884 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF4P15884 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF4P15884 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF4P15884 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF4P15884 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF4P15884 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF4P15884 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF4P15884 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF4P15884 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF4P15884 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF4P15884 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF4P15884 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF4P15884 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF4P15884 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF4P15884 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCF4P15884 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF4P15884 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF4P15884 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF4P15884 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF4P15884 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF4P15884 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF4P15884 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF4P15884 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF4P15884 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF4P15884 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF4P15884 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF4P15884 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF4P15884 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF4P15884 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF4P15884 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF4P15884 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF4P15884 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF4P15884 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF4P15884 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF4P15884 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF4P15884 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF4P15884 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF4P15884 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF4P15884 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF4P15884 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF4P15884 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF4P15884 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF4P15884 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF4P15884 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF4P15884 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF4P15884 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TCF4P15884 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TCF4P15884 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF4P15884 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF4P15884 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF4P15884 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF4P15884 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF4P15884 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF4P15884 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF4P15884 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF4P15884 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF4P15884 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF4P15884 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF4P15884 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF4P15884 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF4P15884 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF4P15884 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF4P15884 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF4P15884 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF4P15884 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF4P15884 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF4P15884 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF4P15884 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF4P15884 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF4P15884 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF4P15884 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF4P15884 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF4P15884 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF4P15884 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF4P15884 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF4P15884 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF4P15884 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF4P15884 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF4P15884 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF4P15884 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF4P15884 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF4P15884 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF4P15884 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF4P15884 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF4P15884 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF4P15884 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF4P15884 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF4P15884 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF4P15884 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF4P15884 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF4P15884 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF4P15884 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF4P15884 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCF4P15884 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCF4P15884 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCF4P15884 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms