Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LCP1P13796 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCP1P13796 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCP1P13796 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCP1P13796 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCP1P13796 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCP1P13796 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCP1P13796 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCP1P13796 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCP1P13796 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCP1P13796 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LCP1P13796 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCP1P13796 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCP1P13796 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCP1P13796 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCP1P13796 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCP1P13796 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCP1P13796 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCP1P13796 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCP1P13796 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCP1P13796 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCP1P13796 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LCP1P13796 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCP1P13796 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LCP1P13796 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCP1P13796 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCP1P13796 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCP1P13796 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCP1P13796 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LCP1P13796 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCP1P13796 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LCP1P13796 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCP1P13796 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCP1P13796 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCP1P13796 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCP1P13796 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCP1P13796 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCP1P13796 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCP1P13796 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCP1P13796 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCP1P13796 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCP1P13796 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCP1P13796 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LCP1P13796 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LCP1P13796 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LCP1P13796 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LCP1P13796 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LCP1P13796 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCP1P13796 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCP1P13796 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCP1P13796 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCP1P13796 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCP1P13796 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCP1P13796 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCP1P13796 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCP1P13796 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCP1P13796 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCP1P13796 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCP1P13796 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCP1P13796 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCP1P13796 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCP1P13796 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCP1P13796 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCP1P13796 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCP1P13796 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCP1P13796 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCP1P13796 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCP1P13796 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCP1P13796 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCP1P13796 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCP1P13796 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCP1P13796 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCP1P13796 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCP1P13796 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCP1P13796 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCP1P13796 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCP1P13796 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCP1P13796 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCP1P13796 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCP1P13796 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LCP1P13796 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCP1P13796 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCP1P13796 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCP1P13796 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCP1P13796 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCP1P13796 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCP1P13796 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCP1P13796 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCP1P13796 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCP1P13796 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCP1P13796 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCP1P13796 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCP1P13796 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCP1P13796 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCP1P13796 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCP1P13796 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCP1P13796 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LCP1P13796 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCP1P13796 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCP1P13796 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms