Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL4P13236 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL4P13236 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL4P13236 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL4P13236 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL4P13236 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL4P13236 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL4P13236 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL4P13236 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL4P13236 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL4P13236 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL4P13236 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL4P13236 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL4P13236 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL4P13236 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL4P13236 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL4P13236 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL4P13236 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL4P13236 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL4P13236 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL4P13236 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL4P13236 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL4P13236 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL4P13236 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL4P13236 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL4P13236 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL4P13236 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL4P13236 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL4P13236 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL4P13236 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL4P13236 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL4P13236 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL4P13236 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL4P13236 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL4P13236 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL4P13236 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL4P13236 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL4P13236 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL4P13236 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL4P13236 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL4P13236 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL4P13236 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL4P13236 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL4P13236 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL4P13236 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL4P13236 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCL4P13236 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL4P13236 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL4P13236 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL4P13236 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL4P13236 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL4P13236 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL4P13236 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL4P13236 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL4P13236 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL4P13236 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL4P13236 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL4P13236 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL4P13236 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL4P13236 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL4P13236 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL4P13236 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL4P13236 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL4P13236 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL4P13236 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL4P13236 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL4P13236 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL4P13236 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL4P13236 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL4P13236 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL4P13236 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL4P13236 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL4P13236 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL4P13236 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL4P13236 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL4P13236 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL4P13236 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL4P13236 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL4P13236 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL4P13236 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL4P13236 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL4P13236 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL4P13236 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL4P13236 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL4P13236 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL4P13236 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL4P13236 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL4P13236 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL4P13236 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL4P13236 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL4P13236 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL4P13236 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL4P13236 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL4P13236 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL4P13236 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL4P13236 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL4P13236 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL4P13236 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL4P13236 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL4P13236 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms