Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VDRP11473 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VDRP11473 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VDRP11473 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VDRP11473 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VDRP11473 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VDRP11473 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VDRP11473 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VDRP11473 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VDRP11473 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VDRP11473 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VDRP11473 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VDRP11473 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VDRP11473 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VDRP11473 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VDRP11473 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VDRP11473 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VDRP11473 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VDRP11473 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VDRP11473 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VDRP11473 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VDRP11473 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VDRP11473 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VDRP11473 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VDRP11473 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VDRP11473 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VDRP11473 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VDRP11473 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VDRP11473 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VDRP11473 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VDRP11473 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VDRP11473 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VDRP11473 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VDRP11473 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VDRP11473 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VDRP11473 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VDRP11473 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VDRP11473 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VDRP11473 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VDRP11473 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VDRP11473 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VDRP11473 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VDRP11473 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VDRP11473 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VDRP11473 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VDRP11473 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VDRP11473 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VDRP11473 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VDRP11473 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VDRP11473 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VDRP11473 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VDRP11473 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VDRP11473 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VDRP11473 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VDRP11473 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VDRP11473 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VDRP11473 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VDRP11473 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VDRP11473 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VDRP11473 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VDRP11473 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VDRP11473 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VDRP11473 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
VDRP11473 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VDRP11473 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VDRP11473 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VDRP11473 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VDRP11473 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VDRP11473 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VDRP11473 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VDRP11473 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VDRP11473 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VDRP11473 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VDRP11473 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VDRP11473 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VDRP11473 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VDRP11473 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VDRP11473 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VDRP11473 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VDRP11473 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VDRP11473 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VDRP11473 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VDRP11473 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VDRP11473 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VDRP11473 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VDRP11473 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VDRP11473 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VDRP11473 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VDRP11473 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VDRP11473 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VDRP11473 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VDRP11473 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VDRP11473 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VDRP11473 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VDRP11473 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VDRP11473 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VDRP11473 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VDRP11473 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VDRP11473 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VDRP11473 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms