Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
GLI2P10070 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
GLI2P10070 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
GLI2P10070 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
GLI2P10070 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
GLI2P10070 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
GLI2P10070 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
GLI2P10070 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
GLI2P10070 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
GLI2P10070 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GLI2P10070 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GLI2P10070 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GLI2P10070 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
GLI2P10070 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
GLI2P10070 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
GLI2P10070 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
GLI2P10070 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GLI2P10070 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
GLI2P10070 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
GLI2P10070 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GLI2P10070 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
GLI2P10070 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
GLI2P10070 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
GLI2P10070 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
GLI2P10070 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
GLI2P10070 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
GLI2P10070 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
GLI2P10070 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
GLI2P10070 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
GLI2P10070 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
GLI2P10070 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
GLI2P10070 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
GLI2P10070 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
GLI2P10070 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
GLI2P10070 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC38.61■■■■□ 3.77
GLI2P10070 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
GLI2P10070 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
GLI2P10070 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
GLI2P10070 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
GLI2P10070 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
GLI2P10070 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
GLI2P10070 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
GLI2P10070 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
GLI2P10070 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
GLI2P10070 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
GLI2P10070 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
GLI2P10070 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
GLI2P10070 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
GLI2P10070 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
GLI2P10070 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
GLI2P10070 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
GLI2P10070 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
GLI2P10070 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
GLI2P10070 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
GLI2P10070 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
GLI2P10070 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
GLI2P10070 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC38.53■■■■□ 3.76
GLI2P10070 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
GLI2P10070 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
GLI2P10070 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
GLI2P10070 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
GLI2P10070 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
GLI2P10070 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
GLI2P10070 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
GLI2P10070 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
GLI2P10070 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
GLI2P10070 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
GLI2P10070 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
GLI2P10070 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
GLI2P10070 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
GLI2P10070 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
GLI2P10070 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
GLI2P10070 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
GLI2P10070 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
GLI2P10070 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
GLI2P10070 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
GLI2P10070 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
GLI2P10070 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
GLI2P10070 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
GLI2P10070 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
GLI2P10070 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
GLI2P10070 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
GLI2P10070 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
GLI2P10070 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
GLI2P10070 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GLI2P10070 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
GLI2P10070 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
GLI2P10070 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
GLI2P10070 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
GLI2P10070 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
GLI2P10070 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
GLI2P10070 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
GLI2P10070 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
GLI2P10070 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
GLI2P10070 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
GLI2P10070 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
GLI2P10070 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
GLI2P10070 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GLI2P10070 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
GLI2P10070 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms