Protein–RNA interactions for Protein: P09630

HOXC6, Homeobox protein Hox-C6, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6P09630 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXC6P09630 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXC6P09630 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXC6P09630 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXC6P09630 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXC6P09630 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXC6P09630 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXC6P09630 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXC6P09630 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXC6P09630 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXC6P09630 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXC6P09630 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXC6P09630 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXC6P09630 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC6P09630 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms