Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOSP01100 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOSP01100 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
FOSP01100 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOSP01100 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FOSP01100 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOSP01100 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOSP01100 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOSP01100 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOSP01100 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOSP01100 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FOSP01100 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOSP01100 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOSP01100 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOSP01100 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOSP01100 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOSP01100 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOSP01100 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FOSP01100 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOSP01100 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOSP01100 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOSP01100 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FOSP01100 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOSP01100 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOSP01100 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FOSP01100 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOSP01100 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FOSP01100 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOSP01100 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FOSP01100 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOSP01100 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOSP01100 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOSP01100 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOSP01100 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOSP01100 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOSP01100 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOSP01100 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FOSP01100 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOSP01100 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOSP01100 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOSP01100 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOSP01100 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FOSP01100 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOSP01100 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOSP01100 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOSP01100 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOSP01100 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOSP01100 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOSP01100 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FOSP01100 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOSP01100 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOSP01100 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOSP01100 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOSP01100 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOSP01100 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOSP01100 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOSP01100 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOSP01100 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOSP01100 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOSP01100 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOSP01100 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOSP01100 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOSP01100 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOSP01100 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOSP01100 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOSP01100 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOSP01100 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOSP01100 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOSP01100 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOSP01100 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOSP01100 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOSP01100 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOSP01100 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOSP01100 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOSP01100 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOSP01100 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FOSP01100 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOSP01100 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOSP01100 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOSP01100 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOSP01100 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOSP01100 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOSP01100 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOSP01100 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOSP01100 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOSP01100 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FOSP01100 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOSP01100 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOSP01100 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOSP01100 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOSP01100 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOSP01100 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOSP01100 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOSP01100 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOSP01100 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOSP01100 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOSP01100 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOSP01100 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOSP01100 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOSP01100 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms