Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYF2O95926 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYF2O95926 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYF2O95926 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYF2O95926 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYF2O95926 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYF2O95926 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYF2O95926 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYF2O95926 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYF2O95926 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYF2O95926 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYF2O95926 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYF2O95926 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYF2O95926 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYF2O95926 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYF2O95926 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYF2O95926 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYF2O95926 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYF2O95926 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SYF2O95926 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYF2O95926 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYF2O95926 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SYF2O95926 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYF2O95926 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYF2O95926 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYF2O95926 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYF2O95926 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYF2O95926 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYF2O95926 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYF2O95926 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYF2O95926 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYF2O95926 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYF2O95926 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYF2O95926 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYF2O95926 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYF2O95926 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYF2O95926 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYF2O95926 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYF2O95926 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYF2O95926 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYF2O95926 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYF2O95926 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYF2O95926 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYF2O95926 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYF2O95926 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYF2O95926 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYF2O95926 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYF2O95926 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYF2O95926 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYF2O95926 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYF2O95926 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYF2O95926 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYF2O95926 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYF2O95926 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYF2O95926 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYF2O95926 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYF2O95926 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYF2O95926 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYF2O95926 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYF2O95926 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYF2O95926 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYF2O95926 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYF2O95926 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYF2O95926 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYF2O95926 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYF2O95926 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYF2O95926 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYF2O95926 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYF2O95926 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYF2O95926 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYF2O95926 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYF2O95926 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYF2O95926 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYF2O95926 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYF2O95926 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYF2O95926 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYF2O95926 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYF2O95926 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYF2O95926 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYF2O95926 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYF2O95926 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYF2O95926 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYF2O95926 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYF2O95926 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYF2O95926 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYF2O95926 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYF2O95926 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYF2O95926 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYF2O95926 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYF2O95926 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYF2O95926 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYF2O95926 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYF2O95926 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYF2O95926 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYF2O95926 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYF2O95926 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYF2O95926 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYF2O95926 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYF2O95926 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYF2O95926 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms