Protein–RNA interactions for Protein: O75558

STX11, Syntaxin-11, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX11O75558 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX11O75558 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX11O75558 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX11O75558 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX11O75558 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX11O75558 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX11O75558 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX11O75558 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX11O75558 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX11O75558 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX11O75558 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX11O75558 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX11O75558 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX11O75558 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX11O75558 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STX11O75558 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX11O75558 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX11O75558 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX11O75558 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX11O75558 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX11O75558 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX11O75558 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX11O75558 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX11O75558 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX11O75558 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX11O75558 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX11O75558 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STX11O75558 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX11O75558 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX11O75558 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX11O75558 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX11O75558 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX11O75558 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX11O75558 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX11O75558 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX11O75558 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX11O75558 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STX11O75558 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX11O75558 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX11O75558 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX11O75558 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX11O75558 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX11O75558 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX11O75558 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX11O75558 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX11O75558 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX11O75558 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX11O75558 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX11O75558 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX11O75558 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STX11O75558 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX11O75558 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX11O75558 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX11O75558 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX11O75558 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX11O75558 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX11O75558 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX11O75558 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX11O75558 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX11O75558 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX11O75558 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX11O75558 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX11O75558 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX11O75558 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX11O75558 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX11O75558 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX11O75558 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX11O75558 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX11O75558 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX11O75558 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STX11O75558 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STX11O75558 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX11O75558 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX11O75558 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX11O75558 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX11O75558 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX11O75558 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX11O75558 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX11O75558 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX11O75558 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STX11O75558 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX11O75558 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX11O75558 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX11O75558 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX11O75558 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX11O75558 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX11O75558 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX11O75558 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STX11O75558 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX11O75558 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX11O75558 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX11O75558 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX11O75558 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX11O75558 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX11O75558 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX11O75558 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX11O75558 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX11O75558 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STX11O75558 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX11O75558 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms