Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF9O60383 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF9O60383 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF9O60383 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF9O60383 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF9O60383 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF9O60383 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF9O60383 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF9O60383 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF9O60383 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF9O60383 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GDF9O60383 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF9O60383 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF9O60383 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF9O60383 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF9O60383 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF9O60383 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF9O60383 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF9O60383 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF9O60383 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF9O60383 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF9O60383 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF9O60383 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF9O60383 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF9O60383 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF9O60383 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF9O60383 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF9O60383 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF9O60383 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF9O60383 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF9O60383 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF9O60383 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF9O60383 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF9O60383 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF9O60383 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF9O60383 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF9O60383 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF9O60383 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF9O60383 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF9O60383 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF9O60383 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF9O60383 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF9O60383 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF9O60383 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF9O60383 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF9O60383 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF9O60383 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF9O60383 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF9O60383 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF9O60383 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF9O60383 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF9O60383 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF9O60383 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF9O60383 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF9O60383 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF9O60383 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF9O60383 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF9O60383 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF9O60383 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF9O60383 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF9O60383 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF9O60383 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF9O60383 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF9O60383 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF9O60383 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF9O60383 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF9O60383 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF9O60383 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF9O60383 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF9O60383 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF9O60383 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF9O60383 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF9O60383 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF9O60383 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF9O60383 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF9O60383 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF9O60383 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF9O60383 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF9O60383 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF9O60383 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF9O60383 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF9O60383 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF9O60383 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF9O60383 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF9O60383 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF9O60383 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF9O60383 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF9O60383 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF9O60383 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF9O60383 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF9O60383 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF9O60383 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF9O60383 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF9O60383 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF9O60383 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF9O60383 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF9O60383 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF9O60383 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF9O60383 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF9O60383 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms