Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MARCH6O60337 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MARCH6O60337 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MARCH6O60337 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MARCH6O60337 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms