Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
SYNJ1O43426 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
SYNJ1O43426 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SYNJ1O43426 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC41.76■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
SYNJ1O43426 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms