Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC58.96■■■■■ 7.03
SYNJ1O43426 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC58.08■■■■■ 6.89
SYNJ1O43426 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.46■■■■■ 6.79
SYNJ1O43426 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.23■■■■■ 6.75
SYNJ1O43426 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.06■■■■■ 6.73
SYNJ1O43426 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.82■■■■■ 6.69
SYNJ1O43426 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.73■■■■■ 6.67
SYNJ1O43426 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC56.46■■■■■ 6.63
SYNJ1O43426 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.59■■■■■ 6.49
SYNJ1O43426 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC55.49■■■■■ 6.47
SYNJ1O43426 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC55.45■■■■■ 6.47
SYNJ1O43426 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55.4■■■■■ 6.46
SYNJ1O43426 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.21■■■■■ 6.43
SYNJ1O43426 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC55.18■■■■■ 6.42
SYNJ1O43426 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.05■■■■■ 6.4
SYNJ1O43426 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC54.88■■■■■ 6.38
SYNJ1O43426 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.78■■■■■ 6.36
SYNJ1O43426 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.76■■■■■ 6.36
SYNJ1O43426 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC54.73■■■■■ 6.35
SYNJ1O43426 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.49■■■■■ 6.31
SYNJ1O43426 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC54.28■■■■■ 6.28
SYNJ1O43426 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.17■■■■■ 6.26
SYNJ1O43426 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.14■■■■■ 6.26
SYNJ1O43426 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.89■■■■■ 6.22
SYNJ1O43426 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53.89■■■■■ 6.22
SYNJ1O43426 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC53.88■■■■■ 6.22
SYNJ1O43426 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.86■■■■■ 6.21
SYNJ1O43426 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.72■■■■■ 6.19
SYNJ1O43426 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53.61■■■■■ 6.17
SYNJ1O43426 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.43■■■■■ 6.14
SYNJ1O43426 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC53.43■■■■■ 6.14
SYNJ1O43426 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.15■■■■■ 6.1
SYNJ1O43426 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.03■■■■■ 6.08
SYNJ1O43426 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC52.89■■■■■ 6.06
SYNJ1O43426 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC52.85■■■■■ 6.05
SYNJ1O43426 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC52.76■■■■■ 6.04
SYNJ1O43426 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC52.66■■■■■ 6.02
SYNJ1O43426 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC52.63■■■■■ 6.02
SYNJ1O43426 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC52.56■■■■■ 6
SYNJ1O43426 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC52.5■■■■■ 5.99
SYNJ1O43426 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC52.37■■■■■ 5.97
SYNJ1O43426 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.37■■■■■ 5.97
SYNJ1O43426 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.31■■■■■ 5.96
SYNJ1O43426 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.16■■■■■ 5.94
SYNJ1O43426 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.12■■■■■ 5.93
SYNJ1O43426 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.98■■■■■ 5.91
SYNJ1O43426 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC51.93■■■■■ 5.9
SYNJ1O43426 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC51.81■■■■■ 5.88
SYNJ1O43426 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC51.78■■■■■ 5.88
SYNJ1O43426 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC51.63■■■■■ 5.86
SYNJ1O43426 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
SYNJ1O43426 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.31■■■■■ 5.8
SYNJ1O43426 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC51.3■■■■■ 5.8
SYNJ1O43426 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC51.29■■■■■ 5.8
SYNJ1O43426 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.25■■■■■ 5.79
SYNJ1O43426 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.24■■■■■ 5.79
SYNJ1O43426 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC51.17■■■■■ 5.78
SYNJ1O43426 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.16■■■■■ 5.78
SYNJ1O43426 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
SYNJ1O43426 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
SYNJ1O43426 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
SYNJ1O43426 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
SYNJ1O43426 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
SYNJ1O43426 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
SYNJ1O43426 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC50.94■■■■■ 5.75
SYNJ1O43426 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.75
SYNJ1O43426 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.94■■■■■ 5.74
SYNJ1O43426 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC50.93■■■■■ 5.74
SYNJ1O43426 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC50.86■■■■■ 5.73
SYNJ1O43426 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
SYNJ1O43426 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC50.85■■■■■ 5.73
SYNJ1O43426 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.72■■■■■ 5.71
SYNJ1O43426 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC50.71■■■■■ 5.71
SYNJ1O43426 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC50.71■■■■■ 5.71
SYNJ1O43426 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.69■■■■■ 5.71
SYNJ1O43426 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
SYNJ1O43426 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.65■■■■■ 5.7
SYNJ1O43426 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.61■■■■■ 5.69
SYNJ1O43426 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.61■■■■■ 5.69
SYNJ1O43426 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.61■■■■■ 5.69
SYNJ1O43426 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.6■■■■■ 5.69
SYNJ1O43426 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.59■■■■■ 5.69
SYNJ1O43426 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
SYNJ1O43426 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC50.55■■■■■ 5.68
SYNJ1O43426 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC50.53■■■■■ 5.68
SYNJ1O43426 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC50.52■■■■■ 5.68
SYNJ1O43426 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC50.46■■■■■ 5.67
SYNJ1O43426 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.67
SYNJ1O43426 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC50.44■■■■■ 5.67
SYNJ1O43426 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.66
SYNJ1O43426 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
SYNJ1O43426 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.36■■■■■ 5.65
SYNJ1O43426 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC50.35■■■■■ 5.65
SYNJ1O43426 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
SYNJ1O43426 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
SYNJ1O43426 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.14■■■■■ 5.62
SYNJ1O43426 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.61
SYNJ1O43426 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.11■■■■■ 5.61
SYNJ1O43426 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.1■■■■■ 5.61
SYNJ1O43426 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC50.05■■■■■ 5.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms