Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 TTC7A-211ENST00000491786 3615 ntTSL 1 (best)9.77□□□□□ -0.852e-7■■■■■ 40.1
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RBFOX2O43251 CARS2-216ENST00000537743 466 ntTSL 53.35□□□□□ -1.872e-9■■■■■ 40.1
RBFOX2O43251 POLD1-212ENST00000600859 3474 ntTSL 211.85□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 40.1
RBFOX2O43251 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 40.1
RBFOX2O43251 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 40.1
RBFOX2O43251 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 40.1
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RBFOX2O43251 STX1A-214ENST00000497980 503 ntTSL 318.83■□□□□ 0.63e-8■■■■■ 39.8
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RBFOX2O43251 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 39.8
RBFOX2O43251 STX1A-208ENST00000480126 724 ntTSL 511.89□□□□□ -0.513e-8■■■■■ 39.8
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RBFOX2O43251 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.693e-8■■■■■ 39.8
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RBFOX2O43251 KYAT1-206ENST00000451800 847 ntTSL 515.49■□□□□ 0.079e-8■■■■■ 39.8
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RBFOX2O43251 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.659e-8■■■■■ 39.8
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RBFOX2O43251 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.529e-8■■■■■ 39.7
RBFOX2O43251 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.529e-8■■■■■ 39.7
RBFOX2O43251 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.569e-8■■■■■ 39.7
RBFOX2O43251 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.639e-8■■■■■ 39.7
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RBFOX2O43251 NPIPA1-201ENST00000328085 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.096e-23■■■■■ 39.7
RBFOX2O43251 NPIPA1-204ENST00000534720 1915 ntTSL 55.35□□□□□ -1.556e-23■■■■■ 39.7
RBFOX2O43251 XXYLT1-208ENST00000473200 698 ntTSL 215.54■□□□□ 0.083e-8■■■■■ 39.6
RBFOX2O43251 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.083e-8■■■■■ 39.6
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RBFOX2O43251 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.17e-10■■■■■ 39.6
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RBFOX2O43251 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.553e-11■■■■■ 39.6
RBFOX2O43251 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.573e-11■■■■■ 39.6
RBFOX2O43251 WDR20-219ENST00000559708 563 ntTSL 34.16□□□□□ -1.743e-11■■■■■ 39.6
RBFOX2O43251 OSBPL9-226ENST00000534040 575 ntTSL 43.85□□□□□ -1.793e-11■■■■■ 39.6
RBFOX2O43251 WDR20-214ENST00000558135 585 ntTSL 23.8□□□□□ -1.83e-11■■■■■ 39.6
RBFOX2O43251 OSBPL9-223ENST00000532975 581 ntTSL 43.5□□□□□ -1.853e-11■■■■■ 39.6
RBFOX2O43251 WDR20-217ENST00000558854 532 ntTSL 22.76□□□□□ -1.973e-11■■■■■ 39.6
RBFOX2O43251 OSBPL9-218ENST00000527631 563 ntTSL 42.57□□□□□ -23e-11■■■■■ 39.6
RBFOX2O43251 OSBPL9-212ENST00000484890 640 ntTSL 31.9□□□□□ -2.113e-11■■■■■ 39.6
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RBFOX2O43251 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.175e-11■■■■■ 39.5
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RBFOX2O43251 SPHK2-209ENST00000599033 618 ntTSL 313.09□□□□□ -0.315e-11■■■■■ 39.5
RBFOX2O43251 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.335e-11■■■■■ 39.5
RBFOX2O43251 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.375e-11■■■■■ 39.5
RBFOX2O43251 SPHK2-207ENST00000598574 1786 nt12.4□□□□□ -0.425e-11■■■■■ 39.5
RBFOX2O43251 SPHK2-204ENST00000593308 713 ntTSL 312.05□□□□□ -0.485e-11■■■■■ 39.5
RBFOX2O43251 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.535e-11■■■■■ 39.5
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