Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 C11orf95-203ENST00000445014 827 ntTSL 526.03■■□□□ 1.763e-6■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.331e-9■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 CLN6-222ENST00000637667 874 ntTSL 1 (best)19.11■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 CLN6-213ENST00000636212 1053 ntTSL 518.13■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 CLN6-220ENST00000637450 868 ntTSL 317.56■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 CLN6-210ENST00000635747 1181 ntTSL 517.45■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 CLN6-218ENST00000637223 652 ntTSL 516.35■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 GTF3C1-211ENST00000569653 897 ntTSL 213.07□□□□□ -0.321e-9■■■■■ 31.7
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PRPF4O43172 CLN6-225ENST00000638144 576 ntTSL 511.85□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 FANCA-208ENST00000561722 696 ntTSL 311.74□□□□□ -0.531e-9■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 CLN6-223ENST00000637823 717 ntTSL 511.74□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.531e-9■■■■■ 31.7
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PRPF4O43172 GTF3C1-209ENST00000568569 540 ntTSL 511.23□□□□□ -0.611e-9■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 FANCA-209ENST00000562424 745 ntTSL 210.93□□□□□ -0.661e-9■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.711e-9■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 FANCA-216ENST00000564870 460 ntTSL 39.72□□□□□ -0.851e-9■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 WDCP-203ENST00000443232 562 ntAPPRIS ALT2 TSL 49.47□□□□□ -0.891e-9■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 GTF3C1-212ENST00000570129 505 ntTSL 59.2□□□□□ -0.941e-9■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 CLN6-203ENST00000563917 557 ntTSL 59.16□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.081e-9■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.391e-9■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 C17orf80-207ENST00000582391 1144 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.41□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 C17orf80-201ENST00000255557 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 C17orf80-204ENST00000426147 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 C17orf80-206ENST00000577615 2049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 C17orf80-209ENST00000585109 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 48.59□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.28e-11■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.718e-11■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.768e-11■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 TBC1D14-204ENST00000439515 602 ntTSL 510.03□□□□□ -0.88e-11■■■■■ 31.7
PRPF4O43172 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-9■■■■■ 31.6
PRPF4O43172 TBC1D16-202ENST00000340848 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.411e-9■■■■■ 31.6
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PRPF4O43172 RPS10-NUDT3-203ENST00000639877 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 31.5
PRPF4O43172 RPS10-NUDT3-201ENST00000605528 595 ntTSL 56.56□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 31.5
PRPF4O43172 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.775e-11■■■■■ 31.5
PRPF4O43172 PPP2CB-207ENST00000520500 603 ntTSL 45.83□□□□□ -1.485e-11■■■■■ 31.5
PRPF4O43172 PPP2CB-202ENST00000518243 577 ntTSL 34.54□□□□□ -1.685e-11■■■■■ 31.5
PRPF4O43172 MAGED2-210ENST00000487463 376 ntTSL 28.01□□□□□ -1.131e-9■■■■■ 31.5
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PRPF4O43172 XYLT2-204ENST00000509778 145 ntTSL 39.96□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 31.2
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PRPF4O43172 ZNF692-219ENST00000496231 656 ntTSL 319.31■□□□□ 0.681e-8■■■■■ 31.2
PRPF4O43172 ZNF692-221ENST00000497847 1031 ntTSL 217.51■□□□□ 0.391e-8■■■■■ 31.2
PRPF4O43172 ZNF692-214ENST00000483223 901 ntTSL 316.98■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 31.2
PRPF4O43172 ZNF692-222ENST00000528141 576 ntTSL 416.96■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 31.2
PRPF4O43172 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.312e-7■■■■■ 31.2
PRPF4O43172 UBE2M-203ENST00000595957 734 ntTSL 214.21□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 31.2
PRPF4O43172 NACC1-203ENST00000586171 534 ntTSL 517.15■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 31.1
PRPF4O43172 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 31.1
PRPF4O43172 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.791e-8■■■■■ 31.1
PRPF4O43172 SNX4-203ENST00000471751 1308 ntTSL 218.67■□□□□ 0.581e-8■■■■■ 31.1
PRPF4O43172 SNX4-204ENST00000473417 754 ntTSL 317.07■□□□□ 0.321e-8■■■■■ 31.1
PRPF4O43172 AL031848.1-201ENST00000419034 351 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.151e-8■■■■■ 31.1
PRPF4O43172 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.931e-8■■■■■ 31.1
PRPF4O43172 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.211e-8■■■■■ 31.1
PRPF4O43172 PMS2P3-205ENST00000437568 1185 ntTSL 523.88■■□□□ 1.412e-11■■■■■ 31.1
PRPF4O43172 PMS2P3-202ENST00000418756 1490 ntTSL 322.13■■□□□ 1.132e-11■■■■■ 31.1
PRPF4O43172 PMS2P3-201ENST00000394921 1316 ntTSL 221.82■■□□□ 1.082e-11■■■■■ 31.1
PRPF4O43172 PMS2P3-204ENST00000430602 1005 ntTSL 215.29■□□□□ 0.042e-11■■■■■ 31.1
PRPF4O43172 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.282e-11■■■■■ 31.1
PRPF4O43172 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 31.1
PRPF4O43172 DNAJC5-202ENST00000470551 5287 ntTSL 214.67□□□□□ -0.064e-8■■■■■ 31.1
PRPF4O43172 SLC2A9-204ENST00000503280 584 ntTSL 47.24□□□□□ -1.255e-15■■■■■ 31
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