RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637667.1

CLN6-222, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLN6, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-222ENST00000637667 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.92■■■■■ 5.58
CLN6-222ENST00000637667 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.61■■■■■ 4.73
CLN6-222ENST00000637667 ABCC9O60706 1549 aa44.44■■■■■ 4.7
CLN6-222ENST00000637667 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.38■■■■■ 4.37
CLN6-222ENST00000637667 NACADO15069 1562 aa42.18■■■■■ 4.34
CLN6-222ENST00000637667 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.06■■■■■ 4.32
CLN6-222ENST00000637667 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.69■■■■■ 4.27
CLN6-222ENST00000637667 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.49■■■■■ 4.23
CLN6-222ENST00000637667 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.45■■■■■ 4.23
CLN6-222ENST00000637667 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
CLN6-222ENST00000637667 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.32■■■■■ 4.2
CLN6-222ENST00000637667 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.25■■■■■ 4.19
CLN6-222ENST00000637667 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.13■■■■■ 4.18
CLN6-222ENST00000637667 SCRIBQ14160 1630 aa40.71■■■■■ 4.11
CLN6-222ENST00000637667 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.65■■■■■ 4.1
CLN6-222ENST00000637667 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.12■■■■■ 4.01
CLN6-222ENST00000637667 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
CLN6-222ENST00000637667 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.01■■■■■ 4
CLN6-222ENST00000637667 NCAPD3P42695 1498 aa38.96■■■■□ 3.83
CLN6-222ENST00000637667 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.87■■■■□ 3.81
CLN6-222ENST00000637667 SMARCA4P51532 1647 aa38.85■■■■□ 3.81
CLN6-222ENST00000637667 SMARCA2P51531 1590 aa38.77■■■■□ 3.8
CLN6-222ENST00000637667 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.72■■■■□ 3.79
CLN6-222ENST00000637667 HMGXB3Q12766 1538 aa38.67■■■■□ 3.78
CLN6-222ENST00000637667 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.5■■■■□ 3.75
CLN6-222ENST00000637667 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.48■■■■□ 3.75
CLN6-222ENST00000637667 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.47■■■■□ 3.75
CLN6-222ENST00000637667 ERCC6Q03468 1493 aa38.36■■■■□ 3.73
CLN6-222ENST00000637667 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.33■■■■□ 3.73
CLN6-222ENST00000637667 NESP48681 1621 aa38.24■■■■□ 3.71
CLN6-222ENST00000637667 CUX2O14529 1486 aa38.2■■■■□ 3.71
CLN6-222ENST00000637667 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.99■■■■□ 3.67
CLN6-222ENST00000637667 WIZO95785 1651 aa37.96■■■■□ 3.67
CLN6-222ENST00000637667 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.82■■■■□ 3.64
CLN6-222ENST00000637667 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.8■■■■□ 3.64
CLN6-222ENST00000637667 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
CLN6-222ENST00000637667 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
CLN6-222ENST00000637667 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.67■■■■□ 3.62
CLN6-222ENST00000637667 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
CLN6-222ENST00000637667 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.46■■■■□ 3.59
CLN6-222ENST00000637667 CFTRP13569 1480 aa37.41■■■■□ 3.58
CLN6-222ENST00000637667 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.36■■■■□ 3.57
CLN6-222ENST00000637667 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.35■■■■□ 3.57
CLN6-222ENST00000637667 WDR62O43379 1518 aa37.34■■■■□ 3.57
CLN6-222ENST00000637667 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.14■■■■□ 3.54
CLN6-222ENST00000637667 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
CLN6-222ENST00000637667 PRDM2Q13029 1718 aa36.91■■■■□ 3.5
CLN6-222ENST00000637667 TOPBP1Q92547 1522 aa36.67■■■■□ 3.46
CLN6-222ENST00000637667 IFT140Q96RY7 1462 aa36.62■■■■□ 3.45
CLN6-222ENST00000637667 ABCC8Q09428 1581 aa36.61■■■■□ 3.45
CLN6-222ENST00000637667 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.54■■■■□ 3.44
CLN6-222ENST00000637667 OSCARQ8IYS5 282 aa36.53■■■■□ 3.44
CLN6-222ENST00000637667 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
CLN6-222ENST00000637667 TRIM41Q8WV44 630 aa36.43■■■■□ 3.42
CLN6-222ENST00000637667 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
CLN6-222ENST00000637667 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
CLN6-222ENST00000637667 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
CLN6-222ENST00000637667 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
CLN6-222ENST00000637667 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.24■■■■□ 3.392e-7■■■■□ 23.4
CLN6-222ENST00000637667 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.18■■■■□ 3.38
CLN6-222ENST00000637667 SOGA1O94964 1423 aa36.17■■■■□ 3.38
CLN6-222ENST00000637667 CUX1P39880 1505 aa36.13■■■■□ 3.37
CLN6-222ENST00000637667 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.12■■■■□ 3.37
CLN6-222ENST00000637667 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
CLN6-222ENST00000637667 FBLN2P98095 1184 aa35.97■■■■□ 3.35
CLN6-222ENST00000637667 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.94■■■■□ 3.34
CLN6-222ENST00000637667 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.94■■■■□ 3.34
CLN6-222ENST00000637667 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.94■■■■□ 3.34
CLN6-222ENST00000637667 WDR97A6NE52 1622 aa35.94■■■■□ 3.34
CLN6-222ENST00000637667 CHD1O14646 1710 aa35.93■■■■□ 3.34
CLN6-222ENST00000637667 ARHGEF11O15085 1522 aa35.9■■■■□ 3.34
CLN6-222ENST00000637667 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.87■■■■□ 3.33
CLN6-222ENST00000637667 GRIN2BQ13224 1484 aa35.82■■■■□ 3.32
CLN6-222ENST00000637667 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
CLN6-222ENST00000637667 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
CLN6-222ENST00000637667 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.73■■■■□ 3.31
CLN6-222ENST00000637667 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.73■■■■□ 3.31
CLN6-222ENST00000637667 SYNJ2O15056 1496 aa35.67■■■■□ 3.3
CLN6-222ENST00000637667 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.66■■■■□ 3.31e-9■■■■■ 46
CLN6-222ENST00000637667 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.66■■■■□ 3.3
CLN6-222ENST00000637667 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.61■■■■□ 3.29
CLN6-222ENST00000637667 SYNJ1O43426 1573 aa35.59■■■■□ 3.29
CLN6-222ENST00000637667 PBRM1Q86U86 1689 aa35.59■■■■□ 3.29
CLN6-222ENST00000637667 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.59■■■■□ 3.29
CLN6-222ENST00000637667 TOP2BQ02880 1626 aa35.59■■■■□ 3.29
CLN6-222ENST00000637667 ARAP1Q96P48 1450 aa35.58■■■■□ 3.29
CLN6-222ENST00000637667 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.56■■■■□ 3.28
CLN6-222ENST00000637667 GRIN2AQ12879 1464 aa35.35■■■■□ 3.25
CLN6-222ENST00000637667 ADAMTS12P58397 1594 aa35.34■■■■□ 3.25
CLN6-222ENST00000637667 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.31■■■■□ 3.24
CLN6-222ENST00000637667 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.27■■■■□ 3.24
CLN6-222ENST00000637667 NUP160Q12769 1436 aa35.24■■■■□ 3.23
CLN6-222ENST00000637667 CEP170Q5SW79 1584 aa35.18■■■■□ 3.22
CLN6-222ENST00000637667 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
CLN6-222ENST00000637667 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.05■■■■□ 3.2
CLN6-222ENST00000637667 SHROOM2Q13796 1616 aa34.99■■■■□ 3.19
CLN6-222ENST00000637667 KIF27Q86VH2 1401 aa34.97■■■■□ 3.19
CLN6-222ENST00000637667 IGF1RP08069 1367 aa34.93■■■■□ 3.18
CLN6-222ENST00000637667 JPH4Q96JJ6 628 aa34.9■■■■□ 3.18
CLN6-222ENST00000637667 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
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