Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC9O14530 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TXNDC9O14530 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TXNDC9O14530 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TXNDC9O14530 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TXNDC9O14530 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TXNDC9O14530 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TXNDC9O14530 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TXNDC9O14530 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TXNDC9O14530 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TXNDC9O14530 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TXNDC9O14530 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TXNDC9O14530 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TXNDC9O14530 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TXNDC9O14530 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms