Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4E171 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4E171 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4E171 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4E171 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4E171 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4E171 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
B4E171 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
B4E171 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B4E171 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B4E171 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B4E171 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
B4E171 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B4E171 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
B4E171 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B4E171 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
B4E171 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
B4E171 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B4E171 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4E171 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4E171 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4E171 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4E171 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4E171 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4E171 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4E171 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4E171 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4E171 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4E171 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4E171 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
B4E171 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
B4E171 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
B4E171 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
B4E171 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
B4E171 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
B4E171 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B4E171 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B4E171 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B4E171 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B4E171 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
B4E171 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B4E171 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
B4E171 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4E171 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4E171 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4E171 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
B4E171 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
B4E171 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4E171 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4E171 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4E171 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4E171 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4E171 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4E171 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4E171 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4E171 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4E171 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
B4E171 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4E171 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4E171 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4E171 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4E171 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4E171 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4E171 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4E171 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4E171 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4E171 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4E171 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4E171 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4E171 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4E171 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4E171 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4E171 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4E171 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4E171 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4E171 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4E171 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4E171 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4E171 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4E171 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4E171 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4E171 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4E171 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
B4E171 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
B4E171 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4E171 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4E171 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4E171 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4E171 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4E171 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4E171 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
B4E171 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4E171 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4E171 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B4E171 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4E171 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4E171 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4E171 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4E171 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4E171 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms