Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC160A6NGH7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC160A6NGH7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC160A6NGH7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC160A6NGH7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC160A6NGH7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC160A6NGH7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC160A6NGH7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms