Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AFDNP55196 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AFDNP55196 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFDNP55196 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFDNP55196 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFDNP55196 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFDNP55196 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFDNP55196 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFDNP55196 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFDNP55196 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFDNP55196 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFDNP55196 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AFDNP55196 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AFDNP55196 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFDNP55196 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFDNP55196 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFDNP55196 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFDNP55196 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFDNP55196 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFDNP55196 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFDNP55196 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFDNP55196 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFDNP55196 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFDNP55196 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFDNP55196 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFDNP55196 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFDNP55196 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFDNP55196 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AFDNP55196 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFDNP55196 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFDNP55196 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFDNP55196 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFDNP55196 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFDNP55196 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFDNP55196 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AFDNP55196 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFDNP55196 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFDNP55196 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFDNP55196 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AFDNP55196 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFDNP55196 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFDNP55196 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFDNP55196 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFDNP55196 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AFDNP55196 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFDNP55196 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFDNP55196 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms