Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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