Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms