Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TBRG4Q969Z0 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 33.2
TBRG4Q969Z0 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 33.2
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TBRG4Q969Z0 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 32.9
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TBRG4Q969Z0 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.286e-6■■■■■ 32.7
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TBRG4Q969Z0 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.396e-6■■■■■ 32.7
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TBRG4Q969Z0 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.914e-8■■■■■ 32.7
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TBRG4Q969Z0 MED15-230ENST00000492381 3619 ntTSL 210.66□□□□□ -0.78e-7■■■■■ 32.5
TBRG4Q969Z0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.836e-7■■■■■ 32.5
TBRG4Q969Z0 FBXO31-204ENST00000565593 2717 ntTSL 519.72■□□□□ 0.756e-7■■■■■ 32.5
TBRG4Q969Z0 AGAP1-203ENST00000402604 563 ntTSL 411.89□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 32.4
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