Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA6P23229 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms