Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms