Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNSTRNQ9Y448 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms