Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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