Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VBP1P61758 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VBP1P61758 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VBP1P61758 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VBP1P61758 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms