Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 TGFB1-202ENST00000597453 392 ntTSL 1 (best)16.7■□□□□ 0.263e-15■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.263e-15■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.213e-15■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 RPS6KA1-215ENST00000529454 544 ntTSL 516.09■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.166e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 HK1-205ENST00000436817 1042 ntTSL 516■□□□□ 0.156e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 ABCB10-202ENST00000486755 612 ntTSL 515.69■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 DDX11-230ENST00000545717 617 ntTSL 315.57■□□□□ 0.083e-15■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.033e-15■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.016e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 RPS6KA1-214ENST00000527264 530 ntTSL 415.03■□□□□ -02e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 GRK2-214ENST00000534651 424 ntTSL 314.95□□□□□ -0.023e-29■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 CPPED1-204ENST00000539677 568 ntTSL 214.78□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.086e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 KDM2B-203ENST00000446152 1549 ntTSL 514.46□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.136e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.136e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.166e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.173e-15■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 GPS1-203ENST00000392357 4076 ntTSL 1 (best)13.96□□□□□ -0.173e-15■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.26e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.26e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.236e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 ODF2-208ENST00000432065 934 ntTSL 513.43□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 TRMT44-207ENST00000531038 541 ntTSL 313.35□□□□□ -0.274e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 HPS1-201ENST00000325103 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.323e-15■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 TAF1-207ENST00000461764 1841 ntTSL 512.97□□□□□ -0.335e-8■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 ZDHHC7-206ENST00000569017 483 ntTSL 412.86□□□□□ -0.353e-15■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 HK1-217ENST00000494253 2848 ntTSL 212.85□□□□□ -0.356e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 TAF1-218ENST00000485087 1738 ntTSL 512.35□□□□□ -0.435e-8■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 MUS81-217ENST00000533555 547 ntTSL 412.33□□□□□ -0.444e-9■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 ARRB1-211ENST00000533255 551 ntTSL 212.07□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 HPS1-204ENST00000361490 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.56e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 HPS1-208ENST00000467246 2791 ntTSL 1 (best)11.76□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 TAF1-211ENST00000468167 1767 ntTSL 511.29□□□□□ -0.65e-8■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 REPS1-216ENST00000529597 2468 ntTSL 510.86□□□□□ -0.673e-15■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 CAMKK1-203ENST00000381769 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 TRMT44-204ENST00000511366 4157 ntTSL 210.73□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 TAF1-208ENST00000462588 1826 ntTSL 1 (best)10.42□□□□□ -0.745e-8■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 GPATCH8-209ENST00000592154 650 ntTSL 29.98□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 TAF1-202ENST00000373775 2199 ntTSL 59.97□□□□□ -0.815e-8■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 TAF1-205ENST00000437147 2295 ntTSL 1 (best)9.79□□□□□ -0.845e-8■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 EIF5A2-201ENST00000295822 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.863e-15■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 KDM2B-206ENST00000538046 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 TP53BP1-212ENST00000476454 2222 ntTSL 29.57□□□□□ -0.885e-8■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 GPATCH8-206ENST00000588554 565 ntTSL 28.29□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 NAA25-207ENST00000551858 2815 ntTSL 1 (best)7.63□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 MRPS28-203ENST00000518371 783 ntTSL 36.61□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.364e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 HK1-216ENST00000493591 916 ntTSL 56.04□□□□□ -1.446e-6■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 TAF1-219ENST00000492404 1249 ntTSL 55.65□□□□□ -1.515e-8■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 MAN2A2-215ENST00000559704 449 ntTSL 34.77□□□□□ -1.653e-18■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 RAF1-210ENST00000491290 572 ntTSL 42.67□□□□□ -1.982e-16■■■■■ 126.4
SF3B1O75533 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 320.51■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 28e-8■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 PTPRF-207ENST00000436724 2168 ntTSL 1 (best)21.94■■□□□ 1.18e-8■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.698e-8■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.378e-8■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.246e-6■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.198e-8■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.148e-8■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 PTPRF-202ENST00000372405 1962 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.118e-8■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 PTPRF-208ENST00000437607 788 ntTSL 1 (best)13.16□□□□□ -0.38e-8■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.356e-6■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 PAPLN-201ENST00000216658 4182 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.376e-6■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.376e-6■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 PAPLN-207ENST00000555123 4108 ntTSL 1 (best)12.63□□□□□ -0.396e-6■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 ARID2-201ENST00000334344 8642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.98e-8■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 MBD5-205ENST00000470063 324 ntTSL 39.19□□□□□ -0.948e-8■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.528e-8■■■■■ 126.3
SF3B1O75533 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 126.2
SF3B1O75533 DGCR8-206ENST00000485802 555 ntTSL 515.43■□□□□ 0.067e-9■■■■■ 126.2
SF3B1O75533 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.017e-9■■■■■ 126.2
SF3B1O75533 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 126.2
SF3B1O75533 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.194e-6■■■■■ 126.2
SF3B1O75533 ANAPC10-203ENST00000502562 743 ntTSL 34.53□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 126.2
SF3B1O75533 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)22.12■■□□□ 1.135e-8■■■■■ 126.2
SF3B1O75533 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)22.12■■□□□ 1.135e-8■■■■■ 126.2
SF3B1O75533 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.135e-8■■■■■ 126.2
SF3B1O75533 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)21.18■□□□□ 0.985e-8■■■■■ 126.2
SF3B1O75533 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.545e-8■■■■■ 126.2
SF3B1O75533 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.365e-8■■■■■ 126.2
SF3B1O75533 NDE1-201ENST00000396354 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.914e-9■■■■■ 126.2
SF3B1O75533 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.074e-9■■■■■ 126.2
SF3B1O75533 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 126.1
SF3B1O75533 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 126.1
SF3B1O75533 SREBF1-204ENST00000395756 3026 ntTSL 218.24■□□□□ 0.517e-7■■■■■ 126.1
SF3B1O75533 SRSF11-214ENST00000484162 4008 ntTSL 1 (best)6.61□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 126
SF3B1O75533 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.551e-6■■■■■ 126
SF3B1O75533 PFKL-208ENST00000491298 819 ntTSL 516.11■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 126
SF3B1O75533 WDR18-210ENST00000591997 577 ntTSL 322.3■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 126
SF3B1O75533 WDR18-209ENST00000591985 1498 ntTSL 520.33■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 126
SF3B1O75533 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 126
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1416.3 ms