RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491298.1

PFKL-208, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 5

Gene PFKL, Length 819 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-208ENST00000491298 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.85■■■■□ 3.49
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PFKL-208ENST00000491298 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.37■■■□□ 2.61
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PFKL-208ENST00000491298 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.44■■■□□ 2.46
PFKL-208ENST00000491298 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.38■■■□□ 2.45
PFKL-208ENST00000491298 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.37■■■□□ 2.45
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PFKL-208ENST00000491298 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.46■■■□□ 2.31
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PFKL-208ENST00000491298 SMARCA4P51532 1647 aa28.91■■■□□ 2.22
PFKL-208ENST00000491298 SMARCA2P51531 1590 aa28.88■■■□□ 2.21
PFKL-208ENST00000491298 HMGXB3Q12766 1538 aa28.86■■■□□ 2.21
PFKL-208ENST00000491298 NESP48681 1621 aa28.86■■■□□ 2.21
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PFKL-208ENST00000491298 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.51■■■□□ 2.15
PFKL-208ENST00000491298 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.43■■■□□ 2.14
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PFKL-208ENST00000491298 TRIM41Q8WV44 630 aa28.23■■■□□ 2.11
PFKL-208ENST00000491298 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.18■■■□□ 2.1
PFKL-208ENST00000491298 WIZO95785 1651 aa28.16■■■□□ 2.1
PFKL-208ENST00000491298 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.14■■■□□ 2.1
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PFKL-208ENST00000491298 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.01■■■□□ 2.07
PFKL-208ENST00000491298 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.92■■■□□ 2.06
PFKL-208ENST00000491298 CFTRP13569 1480 aa27.75■■■□□ 2.03
PFKL-208ENST00000491298 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
PFKL-208ENST00000491298 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
PFKL-208ENST00000491298 OSCARQ8IYS5 282 aa27.67■■■□□ 2.02
PFKL-208ENST00000491298 PRDM2Q13029 1718 aa27.66■■■□□ 2.02
PFKL-208ENST00000491298 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
PFKL-208ENST00000491298 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.53■■■□□ 2
PFKL-208ENST00000491298 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.53■■■□□ 2
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PFKL-208ENST00000491298 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
PFKL-208ENST00000491298 IFT140Q96RY7 1462 aa27.4■■□□□ 1.98
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PFKL-208ENST00000491298 TOPBP1Q92547 1522 aa27.35■■□□□ 1.97
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PFKL-208ENST00000491298 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
PFKL-208ENST00000491298 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.99■■□□□ 1.91
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PFKL-208ENST00000491298 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.85■■□□□ 1.89
PFKL-208ENST00000491298 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.82■■□□□ 1.88
PFKL-208ENST00000491298 SYNJ1O43426 1573 aa26.8■■□□□ 1.88
PFKL-208ENST00000491298 WDR97A6NE52 1622 aa26.78■■□□□ 1.88
PFKL-208ENST00000491298 CUX1P39880 1505 aa26.75■■□□□ 1.87
PFKL-208ENST00000491298 PBRM1Q86U86 1689 aa26.74■■□□□ 1.87
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PFKL-208ENST00000491298 SYNJ2O15056 1496 aa26.66■■□□□ 1.86
PFKL-208ENST00000491298 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.57■■□□□ 1.84
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PFKL-208ENST00000491298 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.45■■□□□ 1.82
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PFKL-208ENST00000491298 ADAMTS12P58397 1594 aa26.38■■□□□ 1.81
PFKL-208ENST00000491298 GRIN2AQ12879 1464 aa26.38■■□□□ 1.81
PFKL-208ENST00000491298 CEP170Q5SW79 1584 aa26.36■■□□□ 1.81
PFKL-208ENST00000491298 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
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PFKL-208ENST00000491298 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.25■■□□□ 1.79
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PFKL-208ENST00000491298 TOP2BQ02880 1626 aa26.21■■□□□ 1.79
PFKL-208ENST00000491298 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.2■■□□□ 1.78
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PFKL-208ENST00000491298 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PFKL-208ENST00000491298 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.03■■□□□ 1.76
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