Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN34H7C241 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN34H7C241 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN34H7C241 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms