Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPR35Q9HC97 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms