Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms