Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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