Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARFGEF3Q5TH69 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms