Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA1Q15788 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms