Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC52.09■■■■■ 5.93
NCOA1Q15788 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC51.03■■■■■ 5.76
NCOA1Q15788 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
NCOA1Q15788 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.45■■■■■ 5.67
NCOA1Q15788 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
NCOA1Q15788 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
NCOA1Q15788 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.27■■■■■ 5.64
NCOA1Q15788 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC50.05■■■■■ 5.6
NCOA1Q15788 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.96■■■■■ 5.43
NCOA1Q15788 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.85■■■■■ 5.41
NCOA1Q15788 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
NCOA1Q15788 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC48.79■■■■■ 5.4
NCOA1Q15788 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC48.69■■■■■ 5.39
NCOA1Q15788 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.39
NCOA1Q15788 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.39
NCOA1Q15788 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC48.64■■■■■ 5.38
NCOA1Q15788 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.58■■■■■ 5.37
NCOA1Q15788 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC48.57■■■■■ 5.37
NCOA1Q15788 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC48.3■■■■■ 5.32
NCOA1Q15788 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
NCOA1Q15788 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
NCOA1Q15788 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
NCOA1Q15788 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC47.91■■■■■ 5.26
NCOA1Q15788 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.89■■■■■ 5.26
NCOA1Q15788 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.78■■■■■ 5.24
NCOA1Q15788 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
NCOA1Q15788 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
NCOA1Q15788 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
NCOA1Q15788 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
NCOA1Q15788 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC47.07■■■■■ 5.13
NCOA1Q15788 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.96■■■■■ 5.11
NCOA1Q15788 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC46.96■■■■■ 5.11
NCOA1Q15788 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
NCOA1Q15788 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
NCOA1Q15788 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
NCOA1Q15788 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC46.74■■■■■ 5.07
NCOA1Q15788 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC46.56■■■■■ 5.04
NCOA1Q15788 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
NCOA1Q15788 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
NCOA1Q15788 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
NCOA1Q15788 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
NCOA1Q15788 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC46.35■■■■■ 5.01
NCOA1Q15788 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
NCOA1Q15788 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
NCOA1Q15788 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
NCOA1Q15788 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC46.05■■■■■ 4.96
NCOA1Q15788 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
NCOA1Q15788 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
NCOA1Q15788 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
NCOA1Q15788 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.65■■■■■ 4.9
NCOA1Q15788 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
NCOA1Q15788 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
NCOA1Q15788 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
NCOA1Q15788 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC45.4■■■■■ 4.86
NCOA1Q15788 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
NCOA1Q15788 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
NCOA1Q15788 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
NCOA1Q15788 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
NCOA1Q15788 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
NCOA1Q15788 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
NCOA1Q15788 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
NCOA1Q15788 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC45.15■■■■■ 4.82
NCOA1Q15788 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
NCOA1Q15788 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
NCOA1Q15788 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
NCOA1Q15788 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC45.05■■■■■ 4.8
NCOA1Q15788 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC45.03■■■■■ 4.8
NCOA1Q15788 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.03■■■■■ 4.8
NCOA1Q15788 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
NCOA1Q15788 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
NCOA1Q15788 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
NCOA1Q15788 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.95■■■■■ 4.79
NCOA1Q15788 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
NCOA1Q15788 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
NCOA1Q15788 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
NCOA1Q15788 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
NCOA1Q15788 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.77
NCOA1Q15788 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
NCOA1Q15788 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC44.76■■■■■ 4.76
NCOA1Q15788 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
NCOA1Q15788 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC44.69■■■■■ 4.75
NCOA1Q15788 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
NCOA1Q15788 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
NCOA1Q15788 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
NCOA1Q15788 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
NCOA1Q15788 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
NCOA1Q15788 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
NCOA1Q15788 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
NCOA1Q15788 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
NCOA1Q15788 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
NCOA1Q15788 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
NCOA1Q15788 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
NCOA1Q15788 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
NCOA1Q15788 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
NCOA1Q15788 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
NCOA1Q15788 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
NCOA1Q15788 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
NCOA1Q15788 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
NCOA1Q15788 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
NCOA1Q15788 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
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