Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDRG4Q9ULP0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDRG4Q9ULP0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDRG4Q9ULP0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms