Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN2A-AS1Q9UH64 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN2A-AS1Q9UH64 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN2A-AS1Q9UH64 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN2A-AS1Q9UH64 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN2A-AS1Q9UH64 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN2A-AS1Q9UH64 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN2A-AS1Q9UH64 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN2A-AS1Q9UH64 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN2A-AS1Q9UH64 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN2A-AS1Q9UH64 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN2A-AS1Q9UH64 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN2A-AS1Q9UH64 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms