Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2A-AS1Q9UH64 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2A-AS1Q9UH64 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2A-AS1Q9UH64 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKN2A-AS1Q9UH64 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN2A-AS1Q9UH64 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKN2A-AS1Q9UH64 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKN2A-AS1Q9UH64 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN2A-AS1Q9UH64 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDKN2A-AS1Q9UH64 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN2A-AS1Q9UH64 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN2A-AS1Q9UH64 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN2A-AS1Q9UH64 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN2A-AS1Q9UH64 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDKN2A-AS1Q9UH64 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDKN2A-AS1Q9UH64 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDKN2A-AS1Q9UH64 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN2A-AS1Q9UH64 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDKN2A-AS1Q9UH64 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKN2A-AS1Q9UH64 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN2A-AS1Q9UH64 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDKN2A-AS1Q9UH64 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKN2A-AS1Q9UH64 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN2A-AS1Q9UH64 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN2A-AS1Q9UH64 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKN2A-AS1Q9UH64 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKN2A-AS1Q9UH64 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN2A-AS1Q9UH64 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN2A-AS1Q9UH64 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN2A-AS1Q9UH64 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN2A-AS1Q9UH64 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN2A-AS1Q9UH64 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN2A-AS1Q9UH64 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN2A-AS1Q9UH64 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN2A-AS1Q9UH64 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN2A-AS1Q9UH64 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN2A-AS1Q9UH64 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN2A-AS1Q9UH64 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKN2A-AS1Q9UH64 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDKN2A-AS1Q9UH64 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDKN2A-AS1Q9UH64 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDKN2A-AS1Q9UH64 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDKN2A-AS1Q9UH64 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN2A-AS1Q9UH64 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDKN2A-AS1Q9UH64 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDKN2A-AS1Q9UH64 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDKN2A-AS1Q9UH64 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN2A-AS1Q9UH64 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN2A-AS1Q9UH64 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN2A-AS1Q9UH64 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKN2A-AS1Q9UH64 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDKN2A-AS1Q9UH64 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN2A-AS1Q9UH64 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN2A-AS1Q9UH64 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDKN2A-AS1Q9UH64 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN2A-AS1Q9UH64 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN2A-AS1Q9UH64 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN2A-AS1Q9UH64 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN2A-AS1Q9UH64 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN2A-AS1Q9UH64 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN2A-AS1Q9UH64 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN2A-AS1Q9UH64 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms