Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PHRF1Q9P1Y6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
PHRF1Q9P1Y6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PHRF1Q9P1Y6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHRF1Q9P1Y6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms