Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 KLHDC4-215ENST00000566349 1377 ntTSL 220.97■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 44.2
AATFQ9NY61 KLHDC4-217ENST00000566661 2232 ntTSL 520■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 44.2
AATFQ9NY61 KLHDC4-208ENST00000562261 1065 ntTSL 318.59■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 44.2
AATFQ9NY61 KLHDC4-212ENST00000564396 563 ntTSL 517.72■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 44.2
AATFQ9NY61 KLHDC4-226ENST00000569747 560 ntTSL 416.7■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 44.2
AATFQ9NY61 KLHDC4-214ENST00000565328 582 ntTSL 416.14■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 44.2
AATFQ9NY61 KLHDC4-218ENST00000567298 4572 ntTSL 516.04■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 44.2
AATFQ9NY61 KLHDC4-213ENST00000564484 562 ntTSL 512.75□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 44.2
AATFQ9NY61 KLHDC4-219ENST00000567513 585 ntTSL 49.26□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 44.2
AATFQ9NY61 TELO2-207ENST00000568240 1327 ntTSL 1 (best)20.03■□□□□ 0.85e-8■■■■■ 44
AATFQ9NY61 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 43.8
AATFQ9NY61 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.134e-7■■■■■ 43.7
AATFQ9NY61 GAK-220ENST00000513935 573 ntTSL 216.34■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 43.7
AATFQ9NY61 GAK-218ENST00000511983 558 ntTSL 414.62□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 43.7
AATFQ9NY61 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.541e-323■■■■■ 43.7
AATFQ9NY61 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.377e-6■■■■■ 43.6
AATFQ9NY61 RPS13-203ENST00000525828 664 ntTSL 221.01■□□□□ 0.955e-22■■■■■ 43.6
AATFQ9NY61 RPS13-204ENST00000526895 561 ntTSL 317.62■□□□□ 0.415e-22■■■■■ 43.6
AATFQ9NY61 RPS13-201ENST00000228140 491 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.365e-22■■■■■ 43.6
AATFQ9NY61 RPS13-202ENST00000525634 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.595e-22■■■■■ 43.6
AATFQ9NY61 RPS13-208ENST00000531908 746 ntTSL 25□□□□□ -1.615e-22■■■■■ 43.6
AATFQ9NY61 MICALL2-209ENST00000479007 1855 ntTSL 222.99■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 43.5
AATFQ9NY61 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.924e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-215ENST00000439101 779 ntTSL 531.98■■■□□ 2.714e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-209ENST00000424537 781 ntTSL 231.54■■■□□ 2.644e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-210ENST00000426941 575 ntTSL 227.72■■■□□ 2.034e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-219ENST00000452891 575 ntTSL 427.72■■■□□ 2.034e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-227ENST00000483603 572 ntTSL 525.62■■□□□ 1.694e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-214ENST00000436917 499 ntTSL 425.62■■□□□ 1.694e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-207ENST00000420551 395 ntTSL 525.48■■□□□ 1.674e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-213ENST00000436402 600 ntTSL 525.04■■□□□ 1.64e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.584e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.54e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-217ENST00000442307 923 ntTSL 224.36■■□□□ 1.494e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.394e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-211ENST00000429279 580 ntTSL 422.2■■□□□ 1.144e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-232ENST00000495372 561 ntTSL 221.98■■□□□ 1.114e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.774e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-216ENST00000440109 935 ntTSL 318.01■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.394e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-220ENST00000461760 644 ntTSL 314.49□□□□□ -0.094e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 STK25-206ENST00000413760 801 ntTSL 311.64□□□□□ -0.554e-6■■■■■ 43.3
AATFQ9NY61 FDFT1-203ENST00000446331 1558 ntTSL 227.93■■■□□ 2.064e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.594e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.474e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.454e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-207ENST00000525607 1773 ntTSL 222.76■■□□□ 1.234e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-217ENST00000530337 741 ntTSL 321.76■■□□□ 1.074e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.054e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.584e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-215ENST00000529464 932 ntTSL 1 (best)17.51■□□□□ 0.394e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.374e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.344e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.264e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-219ENST00000531249 768 ntTSL 216.48■□□□□ 0.234e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-204ENST00000525283 898 ntTSL 315.47■□□□□ 0.074e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.014e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-225ENST00000622850 1987 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.294e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-221ENST00000532266 583 ntTSL 510.3□□□□□ -0.764e-17■■■■■ 43.2
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AATFQ9NY61 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.094e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.094e-17■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 01e-6■■■■■ 43.2
AATFQ9NY61 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.41■■■□□ 2.623e-6■■■■■ 43
AATFQ9NY61 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.82e-6■■■■■ 42.6
AATFQ9NY61 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 224.98■■□□□ 1.592e-6■■■■■ 42.6
AATFQ9NY61 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 42.6
AATFQ9NY61 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 42.6
AATFQ9NY61 MAD1L1-212ENST00000450235 850 ntTSL 320.83■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 42.5
AATFQ9NY61 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.472e-60■■■■■ 42.4
AATFQ9NY61 MICALL2-205ENST00000467783 639 ntTSL 321.6■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 42.1
AATFQ9NY61 ATG16L2-208ENST00000537143 519 ntTSL 227.95■■■□□ 2.063e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 ATG16L2-219ENST00000542908 1178 ntTSL 227.95■■■□□ 2.063e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.053e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.023e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.733e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 EXD3-205ENST00000475006 1132 ntTSL 325.83■■□□□ 1.733e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 ATG16L2-202ENST00000435507 2254 ntTSL 225.08■■□□□ 1.613e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 PAK4-204ENST00000593480 714 ntTSL 324.29■■□□□ 1.483e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.473e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 TMC6-204ENST00000585849 552 ntTSL 223.45■■□□□ 1.343e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 PAK4-210ENST00000599657 534 ntTSL 423.32■■□□□ 1.323e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.313e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.313e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 EXD3-202ENST00000460390 1432 ntTSL 223.01■■□□□ 1.273e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 PAK4-212ENST00000602004 564 ntTSL 422.83■■□□□ 1.253e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 GET4-207ENST00000483469 370 ntTSL 222.56■■□□□ 1.23e-7■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.013e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.853e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 PRELID3A-206ENST00000589565 777 ntTSL 319.71■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.523e-6■■■■■ 41.7
AATFQ9NY61 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 41.7
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