Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A13Q9NSD5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A13Q9NSD5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A13Q9NSD5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms