Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD18Q9NS91 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD18Q9NS91 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD18Q9NS91 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD18Q9NS91 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD18Q9NS91 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms